球隊爲北京理工大學的一支業余足球校隊亦是參加全國大學生足球聯賽和中甲聯賽的球隊曾多次成功衛冕大學生足球聯賽冠軍綽號“學生軍”。
2003年中國足協決定以北京理工足球隊隊員爲主體組建參賽球隊參加世界大學生運動會。
2006年北京理工開始參加乙級聯賽沖擊職業聯賽在全部30名球員中由8名研究生、22名大學生組成可以說是中國職業足壇學歷最高的球隊。同年10月31日北京理工以點球淘汰天津火車頭取得升上明年中國足球甲級聯賽的資格並最終奪得乙級聯賽冠軍。
2007年初由於參加職業聯賽較大學生聯賽需要更多的經費於是北京理工大學開始尋找贊助商並在首場中甲比賽中令人驚奇的以1-0擊敗了老牌甲級球隊南京有有最終位列聯賽第11名。
2010年球隊由中國國少隊主教練張寧兼職主教練。由於本賽季球隊沒有找得贊助商只有北京體育局提供的400萬元。受困資金短缺北京理工很難簽到好外援只能用外國留學生連續三年都是驚險保級。張寧在帶領球隊驚險保級後原本有望留任但因經濟上的原因最終無緣學生軍。
2011年球隊重新獲得了贊助合同6月北京理工大學獲得了全國大學生聯賽的冠軍也是時隔五年後再度奪得冠軍以北京理工大學球員爲主體組成的中國大運足球隊參加同年8月在深圳舉行的世界大學生運動會足球項目結果在1/4決賽以2-3憾負日本隊於八強止步。